La batalla de Muunilinist tuvo lugar cuatro meses después de las Guerras Clon. El general Kenobi dirigió al Ejército Clon a la ciudad de Harnaidan, la sede del Clan de la Banca Intergaláctica, el gremio comercial que financió a los Separatistas. Mientras los hombres de Kenobi atacaron la ciudad de frente, los soldados de élite ARC del Ejército Clon se infiltraron en la ciudad y neutralizaron sus defensas. La batalla culminó con un duelo entre Obi-Wan y el cazarrecompensas Durge, que era un Gen'Dai aparentemente inmortal (una especie formada por músculos y nervios sin forma; no tienen huesos), y la República se tomó el día, tomando muchos de ellos. Los líderes del prisionero del IGBC.
Otra batalla temprana de las Guerras Clon tuvo lugar en Jabiim, un planeta sumido en una guerra civil entre los leales de la República y una facción de rebeldes respaldada por los separatistas, y fue una de las batallas más sangrientas de las Guerras Clon. Se suponía que el general Kenobi había muerto al principio de la batalla, cuando los separatistas liderados por Asajj Ventress y el rebelde de Jabiimi, Alto Stratus, se impusieron a las fuerzas de la República. Anakin Skywalker, que todavía era un aprendiz de padawan en este punto de la guerra, tuvo que liderar un grupo sin maestra de aprendices Jedi y una pequeña banda de soldados clones contra viento y marea. Al final, la batalla se cobró la vida de muchos Jedi, y la República se vio obligada a retirarse. Puedes encontrar esta historia en la serie de cómics Dark Horse, República de Star Wars # 55-58. Es un asunto sombrío, mientras vemos a los maestros Jedi y padawans morir uno por uno, y es una buena medida de lo violento Guerra de las Galaxias puede obtener.
Una de las grandes historias de soldados clon fue contada en el Comando de la República videojuego, que siguió a una élite unida conocida como Delta Squad en una serie de misiones durante la guerra. Juegas como Delta-38, el líder del escuadrón, desde su temprana educación y entrenamiento en Kamino hasta el despliegue en Geonosis, el planeta en el que comenzaron las Guerras Clon. Muy pronto, eres testigo de primera mano de la naturaleza de la línea de ensamblaje de los soldados clon, que son criados para convertirse en máquinas de matar para la República Galáctica, y en última instancia prescindible para los generales y comandantes que siguen en la batalla. El tono general es mucho más oscuro , también, con un enfoque muy liberal de la violencia, la sangre y la sangre, y la explosión de geonosianos.Comando de la República aborda los horrores de la guerra poniéndote en la piel de un soldado "ordinario". Estos soldadosson incapaces de cambiar la galaxia a su alrededor, y al final del juego, la desesperanza de su situación está en plena exhibición. Son prescindibles cuando se trata del esfuerzo de guerra más grande.
Las Guerras Clon La serie animada contó muchas, muchas historias de guerra a lo largo de sus seis años de duración. Una de las más memorables es la Batalla de Umbara, una misión dirigida por Obi-Wan, Anakin y el Maestro Jedi Pong Krell, quien se reveló como un traidor que trabajaba para el Conde Dooku. Krell había previsto el fin de la República y la Orden Jedi y el surgimiento de un nuevo poder galáctico opresivo. Krell decidió salvarse y aliarse con Dooku en lugar de sucumbir como el resto de la Orden. El traicionero Maestro Jedi planeó sabotear la campaña de la República en Umbara, llevando a muchos soldados clones a la muerte, a fin de preservar el control del planeta por parte de los separatistas. Al final, Krell falló y fue ejecutado como traidor. Esta historia dio otro ejemplo de cómo la guerra podría cambiar a un Jedi honorable y convertirlo en el lado oscuro. La verdad, que la República estaba enfrentando sus últimos días, era demasiado para soportar a Jedi como Krell y el Conde Dooku.
Por supuesto, todos sabemos que la visión de Krell se hizo realidad. Aunque la República derrotó a los Separatistas en las Guerras Clon, el gobierno una vez benevolente cambió irrevocablemente, ya que el Canciller Supremo Palpatine estableció el Imperio Galáctico y se declaró a sí mismo gobernante de la galaxia.
