Los cuatro niños, Cynthia, Teresa con la voz de Shannen Doherty de once años-, Martin con la voz de un Wil Wheaton de diez años (que sabía que Wil Wheaton y Shannen Doherty tenían básicamente la misma edad ???) y Timmy, esperan el regreso de su madre. . Son visitados por la malhumorada tía Shrew. Ella espera que la Sra. Brisby esté en casa, para que puedan discutir el próximo día de mudanza, cuando el granjero estará arando la tierra y los animales en los campos circundantes deben huir. Martin le dice insolentemente que no le tiene miedo a nada, ni siquiera al Gran Búho (que nunca ha sido visto por nadie). Él y la tía Shrew se pelean y el viejo roedor sale furioso, justo cuando la señora Brisby entra por la puerta. La musaraña le recuerda a la Sra. B que se acerca el día de la mudanza, pero ahora que el ratón viudo sabe que su hijo tiene neumonía y no puede salir de su cama, deben idear otro plan. Ella hace la medicina en un caldo y pacientemente se la da a Timmy, mientras que los otros niños hacen preguntas preocupadas y se preguntan qué hacer a continuación. (La primera vez que vimos esto, mis hijas seguían preguntando si Timmy también iba a morir … No quería arruinar la película, así que tuve que seguir deteniéndolas).
A la mañana siguiente, la señora Brisby escucha el arranque del tractor del granjero; Tía Shrew corre advirtiendo a todos y todos los animales se escapan. La Sra. Brisby agarra a todos sus hijos, excepto a Timmy, y decide que tiene que detener el arado por su cuenta. Tía Shrew va tras ella, mordiendo la línea de combustible del tractor cuando la señora Brisby se congela de miedo. El arado se detiene, pero todos saben que se solucionará pronto y aún tendrán que moverse.
La sala misteriosa y la voz del comienzo de la película reaparecen. Esta vez, el orador consulta un dispositivo similar a un espejo mágico que le muestra lo que está sucediendo en el mundo exterior. La Sra. Brisby ha decidido que debe superar sus miedos, y Jeremy la está llevando para ir a ver al Gran Búho (con la voz de John Carradine), que es sabio pero esquivo. Jeremy aterriza en un árbol gigantesco con una gran abertura que conduce al interior; él espera mientras la Sra. Brisby entra, navegando a través de la oscuridad, telarañas y huesos variados. Justo antes de ser atacada por una araña grande, un pie gigante la aplasta y se encuentra cara a cara con el Gran Búho. ¿La va a ayudar o se la comerá? Nadie ha visto al Gran Búho y ha vivido para contarlo. Cuando ella le cuenta su situación, él afirma que no hay nada que hacer excepto mover a su familia, incluida Timmy, si ella quiere que sobrevivan. Cuando él le pregunta su nombre y ella le dice que es la Sra. Brisby, él de repente está intrigado y le dice que busque ayuda de las ratas que viven en el rosal de la granja. Deben trasladar su casa al sotavento de la piedra.
Mientras la señora Brisby está tratando de encontrar un camino hacia el rosal espinoso, Jeremy vuelve a aparecer, a pesar de que el gato y la esposa del granjero están cerca. La Sra. Brisby trata de distraerlo enviándolo a vigilar a sus hijos mientras ella está fuera; Jeremy acepta felizmente, aunque casi despierta al gato cuando se va. Una palanca secreta abre una puerta al interior del rosal; Una vez dentro, la Sra. Bris encuentra flores extrañas, luces y pasillos estrechos. Esta es una escena donde la animación realmente brilla; El interior del rosal es un marcado contraste con el exterior espinoso y retorcido. De repente es atacada por una rata grande con ojos brillantes y una lanza; ella trata de explicar que necesita ver a alguien llamado Nicodemo, pero la rata sigue atacándola sin responder (no es una gran primera impresión … ¿se supone que estos tipos la ayudarán?). Finalmente se encuentra con el Sr. Ages, cojeando en un yeso. Cuando ella le dice que la Gran Búho la envió, él acepta llevarla a Nicodemo. En el camino, otra rata se acerca sigilosamente al Sr. Ages y lo agarra, pero solo es Justin, un amigo. Está encantado de conocer a la viuda de Jonathan … y parece que también está enamorado de ella, ¡ay!
Los tres descienden más bajo tierra, donde Justin explica que otra rata, Jenner, se enfrenta al consejo sobre su próximo movimiento. La mayoría de las ratas quieren ser autosuficientes, en lugar de robar su electricidad de la casa del granjero, pero Jenner insiste en que se queden donde están. Al principio, Jenner está horrorizada de que hayan dejado entrar a la señora Brisby, una extraña, a su guarida, pero una vez que se entera de que ella ha venido por ayuda para mudarse de casa, "huele una oportunidad". Ages tiene sus sospechas, pero no tiene idea de que las intenciones de Jenner son asesinas.
